UWM mógł do tej pory nadawać stopnie doktora habilitowanego w czterech dziedzinach: nauk rolniczych, weterynaryjnych, technicznych i biologicznych. Habilitacje, ale wyłącznie z dyscyplin rolniczych, można też było zrobić w Instytucie Rybactwa, należącym do Ministerstwa Rolnictwa i w Instytucie Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności Polskiej Akademii Nauk.